結論から言うと故意でなくても
結果的には店に損害を与える行為で
「間違えたのだから仕方がないだろう」とはなりません。
申告したのに「良いですよ。次は気を付けてください」と言われたのならともかく
間違えたと分かっているのに黙って持ち帰れば犯罪になります
【実例】コンビニコーヒーの押し間違えで逮捕!詐欺罪・窃盗罪に当たる場合を弁護士解説|刑事事件に強い大阪の弁護士法人ロイヤーズハイ google/E8GYm2f9xMibdbBUt">https://share.google/E8GYm2f9xMibdbBUt
今からでも遅くはありません。
嘘も方便。「○○日にセルフコーヒーのレギュラーサイズを買ったのですが、なんか多いなと思って、どうやら間違えてラージを押してしまったようなのですが」とでも言えば対処するでしょう。