交渉期限がバラバラなのは申請日がバラバラだからだよ。
>All 30 MLB clubs have 45 days to negotiate with a player after he is posted.
「MLBの全30チームは、選手が掲示された後その選手と交渉する45日間(の期間)を有する」
https://www.mlb.com/glossary/transactions/japanese-posting-system
ポスティングした日から45日後が期限であり、ポスティングした日が異なれば期限も異なることになる。
ポスティングの日が異なるのは各選手の代理人の戦略によると思われる。
オフシーズンのFA/トレードマーケットは関連するイベントや期限に応じてピークがある。また各チームは獲得ターゲットであるプランAに対するプランBの選手を想定して交渉しているが、プランBに相当する選手はプランAが決まらないうちは契約を決めないことが多い。同様にプランBが決まらないと序列3位以降の選手も決まらない。
代理人はその日程を読んで、交渉を有利に運ぶことができるよう期限から逆算してポスティングの日付を決めることになる。岡本の期限が村上より遅いのは村上よりマーケットでの序列が低いからだろう。
主要なオフシーズンの日程はこちら。
https://www.cbssports.com/mlb/news/mlb-offseason-key-dates-schedule-calendar/