これまでのfgoの冒険は異聞帯での出来事だったので、マリスカルデアスを倒した事で消滅し、本来の汎人類史=別の世界になりました。
その為、マリスカルデアスを倒した後は藤丸が記憶を無くしたというより今までの藤丸は存在しなかった事になり、新しい世界の藤丸になりました。
fgoと本来の汎人類史が分岐したのは2004年(冬木の聖杯戦争が起こった年)です。それ以前の出来事は共通しているので、2004年より前に誕生していたマシュや所長はちゃんと新しい世界にもいます。実際「ロードエルメロイ二世の事件簿」には2004年より以前の汎人類史のオルガマリーが登場しています。
