「更生」と「更正」を、「市立（いちりつ／しりつ）」や「化学（かがく／ばけがく）」のように読み分けない主な理由は、言葉の使われる文脈（専門性）と、読み分ける必要性の低さにあります。
1. 文脈による判別が容易であるため
「市立／私立」や「化学／科学」は、日常会話やニュースで同時に登場する可能性が非常に高く、聞き間違えると重大な誤解を招くため、あえて「いちりつ」「ばけがく」と読み分ける習慣が定着しました。
対して「更生」と「更正」は、使われる場面が明確に分かれています。
更生： 主に「生き方」や「立ち直り」に関する文脈（例：更生保護）。
更正： 主に「事務的・法的な修正」に関する文脈（例：確定申告の更正の請求）。
文脈から意味が自明であるため、あえて読みを変える必要がありません。
2. 「更」の訓読みが限定的であるため
「市（いち）」「私（わたくし）」「化（ばける）」は、単独でもよく使われる一般的な訓読みです。
一方、「更」の訓読みは「さら（さらに）」「ふ（ふける）」であり、これを熟語の頭に当てはめて「さらせい」などと呼ぶには、日本語の語感として不自然さが強く、定着しにくいという側面があります。
3. 法令用語としての厳密性
「更正」は税法などの法律用語として厳格に定義されています。公的な場では正しい音読み（こうせい）を用いることが原則であり、俗称としての訓読み（混ぜ書き読み）を導入する動機が働きにくいという事情もあります。
まとめ
市立・化学： 混同を避けるための「現場の知恵」として読み分けが普及した。
更生・更正： 文脈（人生か、書類か）で判断がつくため、不自然な読み分けを導入する必要がなかった。
