質問者様の想像通りの話の可能性あるとしたら（障がい持たれてる可能性）バス会社に相談するのもありかと思います。
大声上げたり騒いでいる乗客がいるので何とかならないですか？的な事で良いと思います。
他の回答されてる皆様もおっしゃる通り乗車拒否の権限は運転手さんにもありますがなかなか難しいというか、質問者様の推測にもあるように障がい持たれてたら重大な問題に発展してしまいます。
まずは相談というのは、質問者様のように不快に思われているお客様がバス会社に相談していたらバス会社が対策に動きやすくなります。
障がいあるか否かは現状分かりませんが、バス会社（運転手さん）には安全、限りなく定時に近い運行の他にお客様に最大限の快適な運行という使命があります。相談してみて障がいなかったにしても大声で騒がれればお客様誰しも不快なので、バス会社に相談はありに思います。
言い方悪いですが、バス会社もお客様の声が多いと動きやすいというか、運転手さんはこの事例は承知しているはずですが、組織の一員ですから然るべき部署（対策担当する部署）に上がるまで時間かかるし、所属の運転手さんに聞き取りとかあります。
それよりはお客様からの声なら早いという事もあります。
バス会社が動くとしたら、専門家の方のお力借りて大声上げるお客様の身辺を調べて障がいお持ちだったら例えば親族の方や支援施設に通われてたらその施設の方に付き添いが可能かどうか？の話になってきます。
