天窓は年数経つと窓がくすんで、周りのシールも傷んで雨漏りの原因になるので、塗装時に板金納めする方も多々いますね。
内側からも汚れた天窓が見えるのが嫌で壁やカーテンで塞ぐ方もみえます。
雨漏りはないが、結露で腐食してる可能性はあります。
現地確認時に告知してもらえなければわからない事情を考慮すると、屋根のリフォームが無しになってるのであれば、告知義務違反にあたる可能性はあります。
このまま追求して、追完請求もしくは、代金減額請求をするか、インスペクションを入れ雨漏りの確認ができれば、契約解除、損害賠償請求も可能かと思われます。