ネッツトヨタでライズを購入した、今度納車するのですが、事前にスタッドレスをもう預けており納車の時にはもうスタッドレスをつけておいて納車するという形なのですが、元々付いていたタイヤを渡される時、カバーとかってつけてもらえるわけないですよね？

私も今の車を新車購入した際にネットで買ったスタッドレスをディーラーに直接送ってもらいスタッドレスを履いた状態で納車されました。

サマータイヤはビニール製の袋に入れてくれました。

それと質問者様は消費者なので納車されるが正しい表現です。納車するのは販売店側です。