そもそもどちらも影響を与える強さには全く届きません。
書かれているようにAirPodsも基本的に使用しているのはBluetoothです。
Bluetoothの規格はクラスというもので定められており、イヤホンなどで使用されるのはクラス1.5という、最大でも出力が10mWとスマホの数十分の1の出力です。
まず、電磁波というのは「電場(大まかに言えば電気の影響力)が変化すると磁場が変化する」「磁場が変化すると電場が変化する」という、相互に影響しあう変化が空間を伝わっていく、という現象です。これはマクスウェルの方程式、高校物理などでは右ねじの法則などで関係性がしられているものです。
そのうえで電磁波は一定の条件下で影響はありますが、それらが指摘されているのはもっと強いものの数字になります。
上にあげたスマホWHOによって発表された、現在の4G・5G回線よりはるかに強い電磁波を発していた2G回線のデータで、
「30分以上の会話」を「10年間以上毎日」続けた場合、「脳腫瘍になる可能性が増えることを否定しきれない」と、IARCの「グループ2B」に分類した、というものしかありません。
http://www.iarc.fr/en/media-centre/pr/2011/pdfs/pr208_E.pdf
一見影響が大きそうに見えますが、このグループ2Bになっているものには、「コーヒーを毎日飲む」ということで膀胱がんになる可能性、などが含まれている、「確実に安全であると断言できるまではいかない」ものになりますし、こうしたものでさえ後年、影響がないというデータも確認されています。
https://wired.jp/2016/05/25/no-link-between-mobile-phones/
これらをふまえて、
>電磁波による悪影響は軽減しますか?
「悪」影響というのはもともと皆無なので変わりません。
ただの影響としてみても、電磁波の強さ自体はそもそも耳に入れようが極端に距離が変わるわけでもないのでほぼ変わりません。耳に入れたからと影響が変わるわけでもありません。