少なくとも「ダイハツの製造だから故障する」という因果関係は無いと思いますが、個体差や特定ロットの部品などを原因とする不具合発生はあるかもしれません。
自車の狭い所有歴だけで申しますと、トヨタ車とダイハツ車(正確にはダイハツ製のトヨタブランド車)は、他の日産車、ホンダ車、マツダ車との比較では不具合が無く、リコール対策の無償修理が数件のみでした。
日産車は走行に直接関わらない部分の細かな不具合が多く、ホンダ車は走行に関わる部分に危険ではないが潜在的な不具合があり(ネットには同じ意見が散見されましたが、メーカーは不具合と認めなかった)、マツダ車は各部の耐久性が低いという印象でした。
但し、各車を所有した年代が異なりますので、一概には言えない面もあります。あくまでも個人の感想です。