ANAカードを申し込む時に既存のAMC番号を書いていないのですか?
申し込み時に既存のAMC番号を書いていれば口座が統合されているはずです。
こちらで統合されているかどうか確認できます。
https://cam.ana.co.jp/psz/amcj/jsp/renew/amcMemberReference/amcMemberReferenceOS.jsp
ただし、統合すると一番上のランクのカードがメインカードになるため、ANAカードのAMC番号でログインする形になります。
統合されていない場合は下記のフォームで申請するかANAのコールセンターに電話して統合してください。
https://www.ana.co.jp/ja/jp/amc/reference/merit/procedure/pw_change/