参考文献にURLじゃなくてDOIを記載しても大丈夫でしょうか？

構いませんけど，紙に印刷したなら冗長なだけ

ですね。当然ですが，著者・発行年・タイトル・

論文集名・編集機関や学会名・巻号・最初と

最後のページ番号 のすべてを記載した上で，

doi を記載するわけですよね。