水槽のコケ抑制剤ってメダカやその稚魚たちに負担になりますか？

物によります。

殺菌・毒性で苔を駆除する商品は水草やエビに特にダメージが出やすい。

メダカの針子や稚魚に影響が出るかどうかは生まれる前に抑制剤を入れれば水質変化無しでダメージは少ない、生まれた後に抑制剤を入れるとダメージが多少有り(コケは微生物の住処になり針子稚魚の餌が無くなる為)。



硬度を下げる、軟水化させる商品は水質が大きく変わる為、生まれた後に入れるとダメージ有り。