皇室と宮内庁は孝明天皇は暗殺されたと言う疑惑は、本当の話か知っているんですか？

可能性は非常に高いです。

宮廷内に在って天皇の日常を世話をする女官は、毎日、詳細な日記を記述することになっています。非公表ですが、皇室には応仁の乱以降のその種の日記が保管されているそうですので、孝明天皇の逝去される前、数年間の食事状況・排便・排尿状況、体調状況、顔・体の色調、性欲の状況などを専門家が読み解けば自然な病死なのか、それとも別な理由での急死なのか判断は出来ると思います。