結論としては、通勤の快適さ重視なら津田沼、生活の手軽さと家賃バランスなら南柏が無難だと思います。
南柏は南柏駅から柏駅がすぐで、スーパーや飲食店は十分揃っていて日常生活はかなり楽です。ただ常磐線は朝かなり混むので、港区方面だと立ちっぱなし前提になりやすいです。
一方で津田沼駅は徒歩18分がややネックですが、総武線快速や始発が使えるのでタイミング次第で座れるのは大きいですし、駅周辺は商業施設も多く街としては南柏より賑やかです。都内(新宿・渋谷方面)も総武線→山手線で出やすいので遊びも便利です。
通勤ストレスをどこまで許容できるかで決めるのが一番後悔しにくいので、可能なら朝の時間帯に一度現地から試しに電車に乗ってみると判断しやすいですよ。