バス停は深夜の終バス後から始発バス時間前までタクシーは客待ちはできますか？営業と違反について質問です。

駐停車禁止の道路でなければ問題ないと思う。

ただし、質問の趣旨からちょっと離れますが、周辺住民から騒音などの苦情が来る可能性は考慮しなければならない。