40匹はさすがに過密過ぎましたね。
20匹でも過密気味ですが、なんとかかなる思います。
ただ、過密飼育により水質悪化してる状態だろう思うので、そこをなとかする必要があります。
水質悪化の程度が水替えして済む程度ならいいですが、そうじゃない可能性も高そうに思えます。
自分ならもう一つ同じ大きさの飼育容器を立ち上げ、そっちに引っ越すと思います。
自分はメダカ飼育では、濾過もエアレーションも加温もしないので、水さえ入ればどんな容器でも良いのもあり。
なお、1.5cmというのは、よく聞く越冬可能な基準で、自分も人に聞かれたら安全見てそう言う事もあります。
が、実際にはもっと小さくても、氷張る屋外容器で越冬できます。「1匹も落とさず」となると、1.5cmとかになりますが、「ほとんどの子が越冬できる」なら、ウチは北関東ですが、1.2cm程度だと思ってます。
屋外容器の水量や水深が十分なら、1cmくらいでも越冬出来る子も居ますし。
まとめると、以下選択肢があると思います。
1) 屋内飼育容器を増やし立ち上げ、新容器に引っ越す。旧容器はリセット後そちらも使う。
2) 現在の屋内飼育容器を、水換え等を行い水質改善する。過密気味なので頻繁に足し水するなど水質維持の工夫をしながら飼育する。
3) 2に加え、大きめの子を1/3~1/2程度屋外飼育に戻し、屋内飼育の引数を減らす。