役所で手続きをすればできます。
ただし、お父さまが亡くなったからといって、自動的にお母さまの戸籍に入るわけではありません。
今の戸籍の状態にもよりますが、多くの場合はいったん自分だけの戸籍を作ってから、あらためてお母さまの戸籍に入る形になります。
そのため、役所では「分籍」と「入籍」の届出を行うことになります。
手続き自体は市区町村役場の戸籍窓口でできますし、窓口で「母の戸籍に入りたい」と伝えれば、必要な書類や流れを丁寧に案内してもらえます。
状況によって少し違いが出るので、まずは相談するのが一番早いと思います。