至急私は工場で働いてます。下痢など腹痛をも様子場合はサルモネラ菌の可能性がある為出勤停止になる場合があります。その場合有給休みは有給で賄われるのですか？それとも普通の欠勤になるのでしょうか。また有給がない場合。その日は無給になるのでしょうか、

会社の規定を確認というのはもちろんですが、一般的に考えると、
体調不良と同じ扱いで、有給休暇を使う。
有給休暇がないときは欠勤となる。（出勤率が下がるので給与やボーナスに響く）
という理解になる思います。

サルモネラ菌、医師の診断があれば（インフルやコロナのように）出勤停止の特別休暇（有休を使わない欠勤にならないお休み）になるかもしれません。
詳しくは会社の規定や、人事部へ！