メルカリでおとといの夜に商品が発送されたと連絡が来て、今日お問い合わせ番号を追跡してみたら、お問い合わせ番号が見つかりません。」という表示が出てきました。二日くらいでは表示されないこともありますか？

普通にありますよ。

一昨日の夜発送、翌日、昨日、ポストから集荷、昨日から今日、今現在、郵便局で、処理をされていたら、今現在、引受の作業をしている可能性があります。

年賀状、クリスマス、年末年始の郵便物で多忙の時期にて引受になるまで2日前後かかります。もう少しお待ち下さい。

明日には引受になってるかと。