waon pointカード(赤色のカード)は、au payのコード決済だとポイント付与されないのですか？

はい付きませんよ



au PAY アプリで支払って付くポイントは、Pontaポイントです。

WAON POINTカードのポイントはWAON POINT

全く他社の系列のポイントです。



WAON POINTが付くのは、イオンカードでの支払いでか、お会計の前にWAON POINTカードの提示の時だけ。