この夜行バスってバスターミナル東京八重洲で降りずに乗っていたらディズニーシーにつけるということですか？

運賃がことなる可能性があり、乗り越しを断られる場合があります。
冒険とイマジネーションの海へいらっしゃりたいのでしたら最初から降車地を「東京ディズニーシー®」で予約する必要があります。