セーブデータなら消えませんよ。
ただしディスク版のアプリを消す必要が有ります。そうしないとダウンロード版がダウンロード出来ませんので
ホーム→そのアプリに合わせる→コントローラーのオプションボタンを押す→削除
ダウンロード版をダウンロードします。ライブラリーから再ダウンロード。または購入しダウンロードをする
DLCは、ホーム→そのアプリに合わせる→下へ移動しPlayStationストアを選択→あなたの追加アイテムを選択→その中にDLCが有りますので、◯ボタンを選択し再ダウンロードをする
セーブデータは同じ状態じゃないと認識しませんので、全て再ダウンロードします。
これで起動したら出来ます。
DLCが認識しないなら、再起動したら良いかと