辞めてもらっては?
そもそも、従業員には残業をする権利はありません。
残業は上司の許可のもとで認められる行為であり、たかが社員の独断でやって良いことではありません。
しかも上司からの指示に従わずに勝手に残業をするなど、会社の風紀を乱す行為なので、本来は懲戒処分案件です。
その社員を野放しにすると、他にも会社の風紀を乱す人間が出るかも知れませんし、早めに懲戒処分を下すべきかと。
長い目で見たら、弊害の方が大きいと思います。
ただ、そのような人間だと、どこに行っても長続きしないで、転職を繰り返すから収入が増えず、結局お金の足りない人生を送ることになるのでは?と思いますが。