通常、日本の金融機関が年金の送金を規定に遅らせることは考えられませんから、原因はフィリピン側にあるでしょう。
ことしは、カトリックの宗教行事と、国の祭日が4月上旬に集中したためフィリピンの金融機関が業務を全く行わず、そのため処理が遅れたのではないでしょうか？
上旬の6日の遅れは間違いなくこれが原因だと思いますが、15日の分は、その遅れの影響が後ろ向きの押しとなったのではないかと存じます。
現地の日本人商工会議所や日本人会あるいは日本貿易振興機構（JETRO）のマニラ事務所あるいは日本の国際協力機構（JAICA)等に、フィリピンの金融事情について日本語で問い合わせてみてください。
より詳しい内容がわかるかと存じます。
