昨年は定額減税があったからです。
年末調整による還付は所得税です。取りすぎた所得税を還付します。住宅ローン控除はそこからさらに所得税を減らす制度ですが減らせる限界は所得税を0円にするのが限界です。定額減税で源泉徴収された所得税が少なかったので還付される額も少なかったのです。
ただし、年末調整や確定申告では住宅ローン控除はを先に計算します。結果的に定額減税された分(昨年6月からの分)は住宅ローン控除に振り替わりました。その上で定額減税されていないとなれば昨年もしくは今年に給付金があったのでトータルとして住宅ローン控除はされたことになります