2次元の顔みたいって皮肉や悪口ですか？初めましての人に初めて言われた事なので謎です。

２次元の顔みたいとは、褒め言葉として使われます。
漫画やアニメの世界観 漫画やアニメのキャラクターは、現実離れした美しい容姿として描かれることが多いです。
透明感のある肌 大きくて輝く瞳 整った顔のパーツ などが挙げられます。