ご質問に気付くのが遅くなり、遅い回答となり申し訳ありません。
>2日前に性行為(コンドーム使用)があったのですが、その翌日から下腹部に鈍い痛みを感じるようになりました。
本日クリニックを受診したところ、医師から「前立腺が腫れている。状況からクラミジアなどの感染が疑われる」と言われ、尿検査の結果待ちの状態です。(先生には性行為が2日前とは言っていない)
もし2日前が【唯一(フ〇ラなどの唾液の接触も含めて)】の心当たりなのであれば、淋病の潜伏期は短いので淋病を疑うべきです。
ただし医師は所見的にクラミジアの症状の出方に近いとお考えのようですし、2日前より前(ずっと前、何年も前も含む)にも心当たりがあるなら、長期間無症状で潜伏していたクラミジアが体調変化や何らかのトリガー(例えば2日前)で発症したという可能性も高いです。
いずれにせよ、クラミジアと淋病の検査は両方行うべき状況かと思います。先生は多分両方の検査をなさったかと思いますが、念のため次の機会に確認なさると良いでしょう。実際にどうであるかは検査結果が出ないと分かりません。非淋菌性非クラミジア性の炎症ということもあり得ます。