フォルダがなくなったとは、旧スマホからなくなったのですか？
まずはgoogleフォトを誤解している可能性が高いので再確認です。
・googleフォトでは機種間でデータを移行する機能はないです。クラウドに保存して、新旧両端末からそれを覗いているだけです。
・ googleフォトにはフォルダという機能はないです。googleフォトアプリに表示されているフォルダはgoogleフォトのデータではないです。スマホのフォルダです。
・googleフォトのバックアップをオンにしても、すべてのフォルダのデータがバックアップされるとは限りません。そのフォルダのバックアップをオンにしたらフォルダ内の画像がフォトに保存されます。フォルダ自体は保存できません。
結論として、
・googleフォトには新しいスマホに送る機能はありません。googleフォトに保存して新スマホからそれを見ているだけです。
・googleフォトにはフォルダを保存することはないです。なので新端末に移行してないフォルダはgoogleフォトでは見れません。
・バックアップしただけでフォルダを消すこともありません。旧端末にのこっていると思うのでgoogleフォト以外の方法で必要なフォルダを新スマホに移行してください。
・移行方法は新スマホのメーカーに聞いてください。メーカーが移行手段を用意していることが多いです。
