セブンイレブンでnanacoを使いたくて今、支払おうとしたのですが、三菱UFJニコスじゃ出来ないのですか？Apple payで使えないのですか？対応する会社の欄には入っていました

Apple Payでnanacoを使いたいと言う事でしょうか？

だとしたら、nanacoをウォレット（Apple Pay)に登録すれば良いので、カード会社（三菱UFJニコス）は関係ありません。

Apple Payのnanacoへのチャージなら、ブランドがJCB、MasterCard、アメックスならチャージ可能です。（VISAでは出来ません)

https://www.nanaco-net.jp/app/howto/charge/app.html