PayPayでまとめて支払いが有効になっているのを知らなくて親のお金で入金してしまいました。親にバレると思うので話そうと思うのですが、どう説明すればいいでしょうか。

間違ったのであれば間違った、知らなかったといえばいいのでは？

確信犯ならちゃんと理由を伝えて下さい。

伝えて、チャージした額を返すなどしてから、あなたのPayPayの支払い方法からは削除しておきましょう。