申請用写真は必要です。
免許証用の写真は、会場で別に撮影します。
例えば、再交付等手続の案内を見てみてください。
https://www.police.pref.kanagawa.jp/tetsuzuki/menkyo/mes83003.html
「申請用写真」という表現が、「持参写真を運転免許証に使用」ということとは別のことであることがわかります。
このような案内がなぜ新規交付者向けにはないのかというと、おそらく、新規交付では持参写真を免許証に使用することを認めていないために、免許証用持参写真の案内がなく、副次的に、申請用写真を免許証用持参写真と区別する案内もない、ということかと思います。