そもそもプレゼント渡す文化があることを知りませんでした。少なくとも私の代ではそういうの無かったです…
そういうイベントとか誕生日、記念日のプレゼントって見返りは求めず相手に対する気持ちで渡すものだと思っているので、使って貰えないのはショックですけど、逆に次のプレゼント渡す機会があれば参考にするくらいの気持ちで良いかなと思いますよ。
例えばあげるとしても消費するものにしてみるなど。
また私の時は、卒業プレゼントというより進学や就職祝いとしてのプレゼントや旅行、デートが結構ありましたので、もし物自体をあげることに抵抗があるなら、一緒にご飯行ったりデートしたり可能なら旅行とかそういうものでもいいんじゃないでしょうか。
卒業式何もないとしても個人的には何も思わないタイプなので最低とは思いませんよ。