こんにちは、線画お疲れ様です!!
まず質問者様が気になっている目、腕、表情について。
・目…顔に対しての比率、形共に描き進めていけば馴染んでくると思います!どうしても納得いかない場合はゆがみペンや特殊ペンの縮小で大きさを調整してみてください。
・腕…服を着ているにしては細くなっているからではないでしょうか?袖口などは重力で少し下がりますし、ここまでピッタリしていないはずです。
・表情…司、えむ共に根が元気っ子キャラですので口を大きく開けて笑っている描写でもいいかなと思いました。それに伴って、2人のうちどちらかは目を閉じて笑っていてもいいかもしれないですね。
また、全体のバランスを見たときに顔が大きい、または肩幅が狭いように感じます。
そして服ですが、布感があまりなくのっぺりして見えてしまっていると思います。線画は必ず真っ直ぐな線で1本でなければいけないなんて決まりはありません。なんなら布などの柔らかいものは何回かに分けてふんわり描いた方が自然になりますよ。
ここからはついに色塗りですね……!頑張ってください!応援しています。