スマえきの鈍行定期券でサイクルトレインは利用できますか？また、追加料金は発生しませんか？松山-今治間です。

「当該区間に有効な乗車券類でご利用いただけます。」と書いてあります。

乗車券類とは、電車に乗る際のきっぷや定期券やフリーパスなどのすべてのものを言います。
当然、スマえきも含まれると解されます。