情報系の専門学校に通って事務職とか経理職に就くって変ですか？

別に変じゃないですよ。事務職や経理職でも情報系の知識が役立つ場合も多いはずです。働く人の意欲次第です。採用されて意欲を持って働ける職場なら問題ないのではないですか。