鳥居と賽銭箱の設置場所についてある漫画を見ていたら「罪人の打首に使っていた刀を納めたかつての処刑場」と場所が出てきたのですが、そこに鳥居と賽銭箱が設置されていました作中では「神様を奉っている場所ではない」と明確に言われていたのですが、神様を奉っているわけではない場所に鳥居や賽銭箱を設置するということは現実にあるのでしょうか？詳しい方がいたら教えてください

現実にもあり得ます。

鳥居は必ずしも「神様を祀る神社の入口」だけに立つものではなく、「ここから先は俗世と違う領域ですよ」という結界や目印として使われることがあります。処刑場や塚、首塚、慰霊の場のように、恐れや敬意を込めて手を合わせる場所に鳥居が立つ例はあります。

賽銭箱も同じで、正式な神社でなくても「供養」「鎮魂」「祈り」のためにお金を納められるように置かれることがあります。宗教的には神様を祀っていなくても、土地の人が荒ぶるものを鎮めたい、霊を慰めたいという気持ちで小さな祠や碑に近い扱いになることがある、という理解が近いです。