大きな川の水位が上がったときに、合流してる小さな川に逆流しないようにするための水門です。
ある程度長い川ですと、上流で大雨になっても下流では全然降らないということもあります。上流で大雨になって大きな川だけ水位が上がった場合、下流で合流する小さな川側に逆流することがあります。
それを防ぐため、大きな川に合流する小さな川側に水門を設けています。
測量士・測量士補 合格マップ「【河川雑学】樋門、樋管、水門の違いを解説」
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