ポケモンzaの栄養ドリンクは、必ず10単位ずつしか増えないのですか？努力値が1ポイント足りないポケモンに使おうとしたところ、「効果がない」と出てきました。はねを使うことで増やすことはできたのですが、どういう仕様なのか気になって夜も眠れません

いいえ。上限を超えて使用でき、上限分以上の効果は切り捨てられます。

残り1であっても、栄養ドリンクは使用可能です。

先程の画像を見るに、防御に努力値を振っていたのがきのみ再投与で減って、その分合計種族値の余裕が出来て特攻に振れただけじゃないかと思いますが……。