ウェザーニュースのweb版とアプリ版で結構違うのですが、どちらの方が正確なのでしょうか？ 例えば白馬五竜スキー場12/24早朝は、ウェブはミゾレ、アプリ版は雨となっています。

情報源はどちらも気象庁なので、どちらも正しいです。

ただ、更新のタイミングがそれぞれで異なるので、同じタイミングでみるとどちらかの情報が古く、差があるようにみえます。

更新時間の新しい方を参考にすると良いと思います。