元採用担当のおぢさんです。回答が付かないので、想うところだけ書きます。活字なので、もし厳しい感じがしたらごめんなさい。
まず、服装や身だしなみが整っていれば、ニキビはさして問題になりません。面接官は「誠実さ」「話し方」「態度」「コミュ力」等を重視します。コンシーラーで軽く整えれば十分でしょう。むしろ、そこだけに引っ張られて厚化粧の方が印象は下がるものです。
そして、残念ながらニキビはチャームポイントにはなりませんね。むしろ、ESに書いてある内容が突飛やレアである方が、面接官も会えることをワクワクしているケースはあります。人事でも気にしている人が多く、「今日『（特技）縄跳び』の女の子どうなった？」とか「甲子園２回出場はどうだった？」など話が出ることは正直あります。ただ、それは印象値が高いというだけであって、それだけで採用されるわけではないのですけど。
ここから蛇足です。
正直なところ、肌トラブルも程度の問題はあります。アトピーで顔全体に湿疹が出ている場合などは、接客の仕事が可能かどうかなどを検討することになります。センシティブなところですから、本人に完治の可能性を尋ねるわけにもいきません。病気や障害に関する質問は「業務遂行に必要な範囲」に厳しく制限もされてますから。
