貸主は高額請求するかもしれませんが、
敷金の返還をあきらめれば、
追加負担なしくらいにできると思います。
ペット飼育をしていたからと特別な
負担をする必要はないです。
そのための修繕費用が多くなる分は
当然家賃に含まれていると思われます。
4年間借りた期間の通常損耗、経年劣化分は
負担する必要がないというのが法律ですから、
過失部分の修繕費や貼り替え費用を負担すればよく、
交換するとか、全部貼り替えなどという場合は、
耐用年数を考慮した残存価値分を負担すればよく、
新品にして返還する義務まではないので、
全額負担ということにはなりません。
借主が追加請求に応じない場合は、
貸主は請求訴訟をするしかないです。
最悪、いくら支払えという判決がでたら
支払えばよいだけです。
高額にならないことは貸主も理解していますので、
訴訟することはないと思います。