9月に行ったことはないのですが、5月、8月、11月-12月にエジプトに行ったことがあります。
質問者さんのお知り合いがおっしゃるとおり、8月の日中は40℃超えの猛暑なので、遺跡巡りは体力的にかなりキツいです。
私が行った中で1番快適だったのは、昨年の11月の中旬から12月の上旬にかけて行った時で、昼間の気温が25-26℃、帰国日直前の12月初の早朝が13-14℃ぐらいでした。朝晩と昼の気温差はけっこうありました。
この経験をふまえて考えると、9月下旬は猛暑は多少やわらいで日中の最高気温は30℃ちょっとぐらいに下がると思われます。ただ、「涼しい」という感じではないでしょう。
特に南部のルクソール、アスワン、アブ・シンベルはカイロよりも暑いので、9月から10月なら昼間は35℃ぐらいと考えて間違いないと思います。
陽射しが強いし、遺跡巡りでは日陰が少ないので、日中の観光には半袖よりもペラペラの薄い長袖シャツを羽織るほうがおすすめです。帽子やサングラスもあったほうがいいです。
