私立か公立かでも違うと思います。
外部コーチを学校ベースで頼んでいる場合と、顧問や保護者ベースで頼んでいる場合とで話は変わります。
私の息子は全国レベルの公立校でしたが、学校ベースで頼んでいるコーチは学校だけにして、それ以外はOBや保護者の経験者を積極的に呼んで、コーチ代などは部費から出さない様にしていました。
過去の保護者の方がかなり仕組みづくりをしていたので、ほとんど初回の部費しか払っていません。それ以外は、関東大会以上の試合が確定した場合、近隣、OBへの寄付をお願いして回ったりして、その余った費用でオープン戦参加費用を賄っていました。コーチは帯同せず顧問の費用は学校から出るので、顧問には支払っていませんが、個人個人の交通費は各自という感じでした。
予想では、外部コーチを顧問ベースでお願いしてる状況で、単純に1時間5,000円×2時間などを人数で割っているのでは?と思います。そういう所もよくあります。
費用面気になるようであれば、顧問と相談して費用を他から捻出する方法を考えた方が良いかと思います。