ポケモンSV等を皆さんはポケモンホームと連携してますか？

してますよ。

連携したら特典で、特別な特性を持った最初の3匹をもらえます。

各ソフト→ホームのボックス→元のソフトと移動させれば簡単に連携できてそのソフトに戻せなくなることはまずないですし、特にデメリットはないので。