あなたが説明している内容から、特定の漫画を想起させるものがありますが、完全に一致する作品を特定するのは難しいです。メデューサのような見た目を持つ女の子と高校生の男の子とのボーイミーツガールの物語を描いている漫画はいくつか存在します。
ペルセポネとザクロは、ギリシャ神話のキャラクターで、冥王ハデスの妻ペルセポネとその妹ザクロの物語は、多くの作品に登場します。しかし、これらのキャラクターを現代の高校生の物語背景に置く漫画は稀です。
もし、キャラクターのデザインや物語の詳細、あるいはその他の特徴（例えば、設定やスタイルなど）があれば、さらに具体的な作品を想起させられるかもしれません。
Twitter上で話題となっている作品を探すのも一つの方法です。ハッシュタグや特定のユーザー名を探してみるのも有用かもしれません。また、アニメやマンガのレビューサイトやフォーラムでも情報が見つかるかもしれません。
ご参考になれば幸いです。
