片方のプレーはノーファウル判定だったのに、片方のプレーはファウル判定というのがよくあります。ので、同じプレーなのになんで判定が違うんだという感じで詰め寄ることは多々あります。判定は覆らないでしょうけど、その後のジャッジに公平性を促すことができますし、審判のファウル基準も知れるので、その後のプレーで選手も気をつけるようになります。
むしろサッカーは精密なVARがある分、判定は覆りやすいです。
例えば野球なんかは抗議したらイエローもないので即退場処分くらって審判と会話もままならないですし、ビデオ判定も雑すぎて意味がないことが多くあります。それと比べたらサッカーの抗議は審判がしっかり話を返してくれる分、抗議の意味は大いにあります。
もっとも最近は審判を守るルールとして、キャプテン以外は審判に抗議してはならないという規定があるリーグもあります。