クリスタについて質問です。漫画原稿の作品形式を「商業誌用」から「B4サイズ」にしてしまえば絵が変になってしまいますか？以前、作品形式を変えた時に描いた絵が小さくなってしまった時があったので...

普通にご自身で設定欄を見比べればいいだけだと思いますが…

上から下にしたいということですよね？拡大されてしまうので画像が荒れると思います。特に二値だった場合は。

それでもやむを得ない事情があって書き直しが無理とかでしたら、一旦レイヤーを全統合してグレースケールに変換した上で117%拡大してください。ただし画質はやはり悪くなります。