アクアのテールランプ、初代の初期と中期でテールランプが違いますよね？初期に中期のテールランプ付け替えて車検通りますか？

初期ではなく前期です
前期→中期
前期→後期へのテールランプ交換可能です
きちんと点灯する事、点灯した色が赤色であれば前期や中期などを付け替えても問題ないです
赤色に点灯すればスモークテールでも車検通ります