名鉄東岡崎駅で名鉄線のきっぷを購入された時点で、次の3枚のきっぷがお手元にある状態になると思います。
・「名鉄乗車券」（名鉄東岡崎〜名鉄名古屋）
・「JR乗車券」（名古屋市内〜東京都区内）
・「新幹線特急券」（名古屋〜東京）
名鉄名古屋駅では、西改札口を利用されると仮定し、以下、それぞれの駅でのきっぷの使い方をまとめてみます。
＜ルート＞名鉄東岡崎駅＝（名鉄電車）＝名鉄名古屋駅＝（※徒歩)＝JR名古屋駅＝（東海道新幹線）＝東京駅
(※徒歩)名鉄名古屋駅ホーム→名鉄名古屋駅(西改札口)→JR名古屋駅（広小口改札）→JR名古屋駅（新幹線南のりかえ口改札）→新幹線ホーム
【名鉄東岡崎駅】
名鉄東岡崎駅ののりば改札においては、きっぷ１枚（「名鉄乗車券」（東岡崎〜名鉄名古屋））を自動改札機に通します。すると、きっぷが出てくるので受け取り、名鉄電車に乗って名鉄名古屋駅へ向かいます。
【名鉄名古屋駅（西改札口）】
名鉄電車で名鉄名古屋駅に到着したら、ひとつ上の階にある西改札口に向かい、きっぷ１枚（「名鉄乗車券」（東岡崎〜名鉄名古屋））を自動改札機に通します。すると、きっぷは回収され、改札外に出ることができます。
名鉄名古屋駅(西改札口)より改札外に出たら、地上に上がり、次の動画を参考に、JR名古屋駅（広小口改札）へ向かいます。
(動画)「名鉄名古屋駅(西改札口)から新幹線名古屋駅への行き方」
https://youtu.be/W8OvNUWsjVk?si=dWqPkBvgZCkIIE4B
※「名鉄名古屋駅(西改札口)」は、動画1分12秒に、「JR名古屋駅(広小路口改札口)」は動画2分59秒に映っています。
【JR名古屋駅（広小路口改札）】
JR名古屋駅（広小路口改札）においては、きっぷ１枚（「JR乗車券」（名古屋市内〜東京都区内））を自動改札機に通します。すると、きっぷが出てくるので受け取り、JR在来線の構内を歩いてJR名古屋駅（新幹線南のりかえ口改札）へ向かいます。
※「JR名古屋駅(新幹線南のりかえ口改札)」は、動画5分58秒に映っています。
【JR名古屋駅（新幹線南のりかえ口改札）】
JR名古屋駅（新幹線南のりかえ口改札）においては、きっぷ２枚（・「JR乗車券」（名古屋〜東京都区内）・「新幹線特急券」（名古屋〜東京））を自動改札機に重ねて通します。すると、２枚ともきっぷが出てくるので受け取り、新幹線改札内へ。東海道新幹線のぞみ（東京行）に乗って東京駅へ向かいます。
【東京駅】
東京駅に到着したら出口改札に向かい、きっぷ２枚（・「JR乗車券」（名古屋市内〜東京都区内）・「新幹線特急券」（名古屋〜東京））を自動改札機に重ねて通します。すると、きっぷは２枚とも回収され、改札外に出ることができます。
