こんばんは。
Dropboxの警告にある「全ての場所から削除」は、Dropboxアカウントと同期している場所だけが対象になります。つまり、外付けSSDやUSBに自分でコピーしたデータはDropboxとは無関係で、同期対象にも含まれません。
したがって、このボタンを押しても外付けメディア内の画像が消えることはありません。
注意点として、Dropboxフォルダ内の元データを削除すると、同期しているPCやスマホからも消えますが、USBや外付けSSDのように「ただのコピー先」は影響を受けません。
心配であれば、外付けSSDやUSBを抜いた状態で作業しても問題ないです。
結論として、外付けメディアに移した画像が消える可能性はなく、Dropbox内の削除はDropboxの同期範囲にのみ作用します。